La recherche sur le microbiote intestinal ouvre de nouvelles opportunités pour l’industrie alimentaire. Le développement d’ingrédients prébiotiques, la sélection de souches probiotiques aux fonctionnalités spécifiques et le potentiel des postbiotiques pour élargir les applications alimentaires marquent une nouvelle étape dans l’innovation. Des technologies telles que la fermentation avancée, les modèles de digestion in vitro et la microencapsulation contribuent à développer des produits plus précis, stables et évalués scientifiquement.
La santé intestinale s’est imposée comme l’un des principaux domaines de l’innovation alimentaire. Les progrès dans la connaissance du microbiote et de ses liens avec différentes fonctions de l’organisme favorisent de nouvelles stratégies visant à développer des aliments et des ingrédients capables de moduler l’écosystème intestinal. Dans ce contexte, les prébiotiques, les probiotiques et les postbiotiques offrent des voies d’innovation complémentaires, chacune avec ses propres mécanismes d’action et défis technologiques.
En Espagne, l’intérêt croissant pour les aliments fermentés reflète le dynamisme de ce domaine. Selon le ministère de l’Agriculture, de la Pêche et de l’Alimentation (MAPA), leur consommation a augmenté de 120 % depuis 2020. En octobre 2026, le ministère a ouvert une consultation publique préalable à l’élaboration de la première norme de qualité spécifique au kéfir, dans le but d’établir des critères concernant sa fabrication, sa commercialisation, sa dénomination et son étiquetage. La période de soumission des observations s’est achevée le 30 octobre.
Bien que les aliments fermentés ne soient pas nécessairement des probiotiques ni des postbiotiques, cette initiative souligne l’importance de caractériser les micro-organismes utilisés, de standardiser les procédés de production et de fournir aux consommateurs des informations claires.
Par ailleurs, le rapport Biotics: Deliver Targeted and Personalised Ingredients, de Mintel, identifie une évolution vers des ingrédients biotiques plus spécifiques, étayés par des preuves scientifiques et ciblant des besoins de santé précis. Parmi les opportunités qu’il souligne figurent les ingrédients prébiotiques aux propriétés différenciées, les souches probiotiques aux fonctionnalités définies et les nouvelles applications des postbiotiques dans différents formats alimentaires.
Prébiotiques et fibres fonctionnelles : de nouvelles opportunités pour la santé intestinale
Les prébiotiques jouent un rôle important dans la modulation du microbiote intestinal. Il s’agit de substrats utilisés de manière sélective par les micro-organismes de l’hôte et qui apportent un bénéfice pour la santé.
Bien que certaines fibres alimentaires possèdent des propriétés prébiotiques, toutes les fibres ne peuvent pas être considérées comme des prébiotiques. Cette distinction est essentielle dans le développement de nouveaux ingrédients, car leur fonctionnalité dépend aussi bien de leur composition et de leur structure que de leur interaction avec le microbiote.
Le rapport de Mintel place les fibres et les ingrédients prébiotiques parmi les principaux axes d’innovation en matière de santé intestinale. La diversification des sources de fibres et les formulations combinant différents ingrédients permettent d’élargir l’offre d’aliments fonctionnels. De plus, l’innovation évolue vers des prébiotiques aux propriétés mieux définies : Mintel identifie des opportunités dans les fibres permettant d’adapter les formulations à différents besoins digestifs, en tenant compte de leur fermentescibilité, de leur tolérance et de leur dose d’utilisation. Pour l’industrie, cela exige d’approfondir la caractérisation des ingrédients et d’étudier leur comportement pendant la digestion et la fermentation intestinale.
Dans ce contexte, des technologies telles que les procédés enzymatiques, la biotransformation et la valorisation des matières premières végétales permettent d’explorer de nouvelles sources d’ingrédients fonctionnels. Chez AINIA, nous disposons de capacités de développement et de caractérisation d’ingrédients, de procédés biotechnologiques et de modèles de digestion in vitro qui contribuent à étudier leur potentiel et à faciliter leur incorporation dans de nouveaux aliments.
Probiotiques de précision : de la sélection des souches à de nouvelles fonctionnalités
Parallèlement à l’évolution des prébiotiques, l’innovation dans le domaine des probiotiques progresse vers l’identification de micro-organismes aux propriétés et aux applications de plus en plus définies.
Selon Mintel, 63 % des consommateurs interrogés qui utilisent, ou pourraient utiliser, des produits pour la santé intestinale considèrent qu’il est important que les probiotiques expliquent clairement les fonctions spécifiques de leurs souches.
Cette tendance renforce le rôle de la sélection et de la caractérisation microbiologique, car les propriétés d’une souche ne peuvent pas être automatiquement extrapolées à d’autres, même si elles appartiennent à la même espèce. Identifier des micro-organismes présentant un potentiel fonctionnel et développer des procédés fermentaires reproductibles constitue une voie pour obtenir des ingrédients différenciés et adaptés à différentes applications alimentaires.
Dans ce domaine, chez AINIA, nous avons progressé grâce au projet BIOPROSPECT, dans le cadre duquel nous avons isolé plus de 100 souches microbiennes provenant de différents environnements naturels afin d’étudier leur potentiel dans les domaines de l’alimentation et de la santé.
La recherche a combiné des analyses génétiques, des essais in vitro simulant les conditions digestives et une plateforme automatisée pour le criblage à haut débit et le suivi de la croissance microbienne. Ces outils permettent d’étudier des propriétés telles que la résistance aux conditions gastro-intestinales et la capacité fermentaire, et accélèrent la sélection de souches candidates présentant un potentiel probiotique pour de futures applications industrielles.
Les essais de résistance au pH acide et aux sels biliaires sont utiles pour identifier des souches candidates, bien que leurs résultats ne suffisent pas, à eux seuls, à démontrer qu’une souche apporte un bénéfice pour la santé et peut être considérée comme probiotique.
Postbiotiques : une nouvelle voie pour élargir les applications alimentaires
Parmi les tendances émergentes identifiées par Mintel, les postbiotiques se distinguent par les possibilités qu’ils offrent pour développer de nouvelles formulations d’aliments fonctionnels.
Selon la définition de l’Association scientifique internationale pour les probiotiques et les prébiotiques (ISAPP, selon son acronyme anglais), les postbiotiques sont des préparations de micro-organismes inanimés et/ou de leurs composants qui apportent un bénéfice pour la santé.
Contrairement aux probiotiques, les postbiotiques n’ont pas besoin de micro-organismes vivants pour exercer le bénéfice démontré. Cette caractéristique peut faciliter leur incorporation dans certaines matrices alimentaires, notamment lorsque les conditions de transformation ou de conservation compromettent la viabilité des probiotiques. Toutefois, leur stabilité et leur fonctionnalité doivent être évaluées dans chaque formulation.
Mintel identifie des opportunités pour incorporer ces préparations dans de nouvelles matrices alimentaires, y compris des produits stables à température ambiante. Cela ouvre la voie à des formats et des catégories dans lesquels l’utilisation de probiotiques vivants présente de plus grandes difficultés technologiques. Toutefois, l’inactivation d’un micro-organisme ne suffit pas pour obtenir un postbiotique. Il est nécessaire de sélectionner et de caractériser les micro-organismes de départ, de définir des procédés adaptés de production et d’inactivation, de garantir la sécurité de la préparation et de disposer de preuves étayant son bénéfice pour la santé. De même, les métabolites microbiens isolés ne peuvent pas être automatiquement considérés comme des postbiotiques.
La fermentation avancée et les technologies de formulation peuvent contribuer au développement de ces ingrédients. Chez AINIA, nos capacités en biotechnologie industrielle nous permettent d’étudier des micro-organismes d’intérêt, d’optimiser les procédés fermentaires et de développer de nouveaux ingrédients d’origine microbienne.
Pour sa part, la microencapsulation permet de protéger les ingrédients sensibles, d’améliorer leur stabilité et de concevoir des systèmes de libération contrôlée. Chez AINIA, nous appliquons ces technologies au développement de formulations contenant des probiotiques et d’autres composés bioactifs, et nous les combinons avec des outils de caractérisation et d’évaluation fonctionnelle. Ces capacités ouvrent des possibilités pour étudier de nouvelles formulations contenant des préparations postbiotiques, en tenant compte des caractéristiques de chaque ingrédient, des conditions de transformation et des exigences du produit final. Dans chaque cas, leur application nécessite des études confirmant leur faisabilité technologique et leur fonctionnalité.
Les preuves scientifiques, essentielles pour différencier les ingrédients biotiques
Le développement de prébiotiques, de probiotiques et de postbiotiques pose un défi commun : disposer de preuves scientifiques permettant de caractériser leurs propriétés et d’étayer les bénéfices qui leur sont attribués.
Le rapport de Mintel indique que 56 % des utilisateurs de produits pour la santé digestive interrogés avaient du mal à savoir si ces produits fonctionnaient ou si leurs symptômes s’étaient améliorés naturellement.
Cette incertitude renforce la nécessité d’étudier le comportement des ingrédients pendant la digestion, leurs interactions avec le microbiote et les mécanismes biologiques susceptibles d’intervenir dans leurs effets.
Pour progresser dans ce domaine, chez AINIA, nous avons développé, dans le cadre du projet DISBIOSIS, des modèles expérimentaux in vitro permettant de reproduire des altérations du microbiote intestinal et d’étudier leur interaction avec l’environnement gastro-intestinal.
Parmi les avancées, on distingue un système expérimental de type organ-on-chip qui intègre des aspects de la digestion gastro-intestinale, du microbiote du côlon et de la muqueuse intestinale. Ces outils permettent d’étudier les mécanismes d’action et d’évaluer le potentiel de nouveaux ingrédients fonctionnels dans des conditions contrôlées.
Dans la continuité de cet axe de recherche, DISBIOSIS II a notamment pour objectifs d’approfondir la caractérisation des agents bioactifs dérivés du microbiote et de développer des modèles expérimentaux plus complexes pour étudier leur interaction avec l’organisme.
Bien que ces modèles ne remplacent pas les essais cliniques nécessaires pour démontrer certains bénéfices chez l’être humain, ils fournissent des informations précieuses pour orienter la sélection des ingrédients et progresser dans leur évaluation fonctionnelle.
De même, il convient de distinguer la production de preuves scientifiques de l’autorisation des allégations de santé. La caractérisation et les études de fonctionnalité permettent de progresser dans l’évaluation de nouveaux ingrédients, mais la communication des bénéfices pour la santé sur l’étiquetage ou dans la publicité des denrées alimentaires doit respecter les exigences de la réglementation européenne relative aux allégations nutritionnelles et de santé.
De la recherche au développement de nouveaux aliments fonctionnels
L’innovation dans le domaine des ingrédients biotiques ne s’arrête pas à l’identification de nouvelles fibres, de micro-organismes ou de préparations d’origine microbienne. Leur incorporation dans les aliments et les compléments alimentaires nécessite de résoudre des questions de sécurité, de stabilité, de dosage, de caractéristiques sensorielles et de viabilité industrielle.
Comme nous l’expliquons dans notre article sur les tendances de Vitafoods Europe 2026, le secteur des ingrédients fonctionnels évolue vers des formats plus diversifiés, soutenus par des technologies de formulation avancée et des exigences accrues en matière de preuves scientifiques.
Dans ce contexte, la combinaison de la fermentation avancée, de la caractérisation microbiologique, des procédés d’obtention et de transformation des ingrédients, des modèles de digestion in vitro et de la microencapsulation permet d’aborder les différentes étapes du développement technologique : de l’identification des composés d’intérêt à la formulation et à l’évaluation de nouveaux produits.
Les prébiotiques, les probiotiques et les postbiotiques offrent des opportunités complémentaires pour évoluer vers une alimentation fonctionnelle plus spécialisée. Alors que les nouvelles sources de fibres et les probiotiques de précision élargissent les possibilités d’agir sur le microbiote, les postbiotiques ouvrent des voies supplémentaires pour explorer des formulations aux propriétés technologiques différenciées.
Pour l’industrie alimentaire, le défi ne consiste pas seulement à incorporer de nouveaux ingrédients, mais aussi à combiner les connaissances scientifiques et les capacités technologiques pour développer des produits sûrs, stables et aux fonctionnalités bien caractérisées. L’intégration de la biotechnologie, de l’évaluation fonctionnelle et du développement industriel sera essentielle pour transformer les avancées de la recherche sur le microbiote en nouvelles opportunités d’innovation alimentaire.
