Bioprospeção para identificar novos micro-organismos com potencial industrial

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Ainoa Escrich

23 Dec 2025

A procura de micro-organismos com propriedades funcionais diferenciadoras é atualmente uma das principais alavancas de inovação nos setores alimentar, farmacêutico e biotecnológico. Neste contexto, no projeto BIOPROSPECT, trabalhámos na identificação, caracterização e validação funcional de novas estirpes microbianas através de estratégias avançadas de bioprospeção, combinadas com ferramentas tecnológicas que permitem agilizar e otimizar a sua avaliação.

O BIOPROSPECT permitiu avançar no conhecimento e na obtenção de bactérias ácido-lácticas (BAL) com potencial fermentativo e probiótico, bem como desenvolver uma plataforma automatizada para a cribagem e monitorização do crescimento microbiano, claramente orientada para a sua futura aplicação industrial.

Vídeo: resultados e abordagem tecnológica do BIOPROSPECT

Neste vídeo, apresentamos os principais resultados do projeto e a abordagem tecnológica desenvolvida para identificar e avaliar micro-organismos de interesse a partir de ambientes marinhos profundos e amostras humanas, bem como o seu potencial para gerar novas soluções biotecnológicas.

Bioprospeção em ambientes diversificados para ampliar a biodiversidade microbiana

No âmbito do BIOPROSPECT, a bioprospeção microbiana foi abordada a partir de duas origens complementares. Por um lado, foram realizadas campanhas de amostragem em fundos marinhos profundos, com o objetivo de identificar géneros microbianos ainda pouco explorados e com potencial biotecnológico. Por outro lado, trabalhámos com amostras humanas provenientes de lactentes, uma fonte particularmente relevante para o isolamento de bactérias ácido-lácticas associadas ao ecossistema intestinal.

A partir destas fontes, foram isoladas mais de 100 estirpes bacterianas, que foram posteriormente submetidas a um processo estruturado de cribagem e seleção.

Caracterização genotípica e funcional das estirpes selecionadas

Uma parte significativa das estirpes isoladas foi sujeita a uma caracterização genotípica completa, recorrendo a técnicas de sequenciação que permitiram obter um perfil genético detalhado. Esta abordagem possibilitou avaliar a inocuidade de cada micro-organismo e identificar propriedades funcionais de interesse industrial.

De forma complementar, foi realizada uma caracterização fenotípica aprofundada, avaliando parâmetros-chave como a tolerância a condições adversas, a capacidade fermentativa e o potencial probiótico. Estes estudos foram apoiados por ensaios in vitro destinados a avaliar a resistência ao trânsito gastrointestinal e à fermentação colónica, bem como a capacidade dos micro-organismos para aderir a modelos epiteliais, fornecendo informação relevante sobre o seu potencial probiótico.

Os resultados obtidos confirmam que várias das estirpes avaliadas apresentam resistência a pH ácido e a sais biliares, um comportamento fermentativo favorável e uma interação eficaz com modelos epiteliais, reforçando o seu interesse para aplicações nas áreas da alimentação e da saúde.

digestores AINIA

Plataforma automatizada para a cribagem e monitorização microbiana

Como um dos principais avanços tecnológicos do projeto, o BIOPROSPECT permitiu o desenvolvimento de uma plataforma automatizada que possibilita a cribagem em larga escala e a monitorização em tempo real do crescimento microbiano sob diferentes substratos e condições experimentais.

Esta ferramenta permitiu otimizar os tempos de avaliação, melhorar a reprodutibilidade dos ensaios e facilitar a comparação objetiva entre estirpes, acelerando assim a tomada de decisões nos processos de seleção com vista ao escalonamento e à aplicação industrial.

Validação do potencial industrial em matrizes lácteas e vegetais

O projeto contou com a colaboração das empresas ALNUT, DACSA e NATRA, com as quais foram iniciados estudos orientados para a aplicação industrial das estirpes selecionadas. Neste âmbito, foi avaliado o potencial fermentativo de estirpes previamente caracterizadas, utilizando leite inteiro como matéria-prima, com o objetivo de desenvolver um iogurte sem necessidade de recorrer a culturas starter adicionais.

Em paralelo, foram realizados ensaios de fermentação em matrizes vegetais, incluindo farinhas e outros substratos, abrindo caminho ao desenvolvimento de produtos inovadores adaptados a diferentes mercados e alinhados com as novas tendências da alimentação e da biotecnologia.

colaboración empresa

A bioprospeção como motor da inovação biotecnológica

Os resultados do BIOPROSPECT confirmam o valor da bioprospeção como estratégia para identificar micro-organismos com propriedades diferenciadoras e acelerar a sua transferência para aplicações reais. A combinação da biodiversidade microbiana, de ensaios funcionais avançados e de ferramentas automatizadas de cribagem reforça a capacidade de gerar soluções biotecnológicas com impacto industrial.

Na AINIA, estes avanços consolidam o nosso posicionamento como parceiro tecnológico para empresas que procuram inovar no desenvolvimento de ingredientes, processos fermentativos e soluções baseadas em micro-organismos funcionais.

Esta iniciativa contou com o apoio da Conselleria d’Innovació, Indústria, Comerç i Turisme da Generalitat Valenciana, através do IVACE, e com financiamento da União Europeia no âmbito do Programa FEDER Comunitat Valenciana 2021–2027, contribuindo para o posicionamento da Comunidade Valenciana no desenvolvimento da biotecnologia baseada em micro-organismos, na inovação em fermentação e na transferência de conhecimento para aplicações industriais e alimentares de elevado valor acrescentado.

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Ainoa Escrich

Técnico en Biotecnología Industrial

Hola, soy Ainoa Escrich, doctora en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra (2021), donde me especialicé en la obtención de compuestos bioactivos derivados de plantas y microorganismos. Mi trayectoria académica comenzó con el grado en Biotecnología por la Universidad de Valencia (2011), y posteriormente completé el máster en Biotecnología, Genómica y Biología Celular en la Universitat Autònoma de Barcelona (2017). A lo largo de mi carrera he tenido la oportunidad de realizar varias estancias en el extranjero, lo que me ha permitido ampliar mi visión científica y colaborar en proyectos internacionales. Además, he participado en diversos congresos y publicado varios artículos científicos relacionados con mis líneas de investigación.  

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